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豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒說(shuō)明書(shū)

 發(fā)布時(shí)間:2019/4/8 點(diǎn)擊量:814

豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒

 

【產(chǎn)品名稱(chēng)】

通用名稱(chēng):豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒(實(shí)時(shí)熒光PCR法)

英文名稱(chēng)Porcine epidemic diarrhea virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)

【包裝規格】 25T/盒 & 50T/盒

【預期用途】

本試劑盒利用實(shí)時(shí)熒光PCR原理,定性檢測豬流行性腹瀉病毒,對豬流行性腹瀉病毒引起的疾病診斷及療效評估有重要指導意義。

【檢驗原理】

本試劑盒針對豬流行性腹瀉病毒的高度保守區域設計特異性引物和探針,在反應體系中含豬流行性腹瀉病毒基因組模板的情況下,PCR反應得以進(jìn)行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過(guò)程中相應通道信號進(jìn)行實(shí)時(shí)監測和輸出,實(shí)現檢測結果的定性分析。

【主要組成成份】

序號

組成

25T/盒

50T/盒

1

PEDV RT-PCR反應液

375 μL×1管

750 μL×1管

2

  PEDV逆轉錄酶

 50 μL×1管

100 μL×1管

3

  PEDV Taq酶

 75 μL×1管

150 μL×1管

4

  PEDV陽(yáng)性對照

 40 μL×1管

 40 μL×1管

5

  PEDV陰性對照

 40 μL×1管

 40 μL×1管

6

說(shuō)明書(shū)

1份

1份

注:陰性對照為基因組DNA,陽(yáng)性對照為失去活性的豬流行性腹瀉病毒cDNA。

【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個(gè)月。

【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

【樣本要求】

1. 適用標本類(lèi)型:發(fā)病動(dòng)物血液、空腸及小腸腸內容物及組織臟器(腸道組織、腸系膜及淋巴結等)和病毒培養液。

2. 標本采集,方法如下:

(1) 血清:用一次性注射器取靜脈血2-3ml,轉至5ml 的干燥管中,密閉送檢。

(2) 腸內容物:無(wú)菌條件下取腸道內容物約1g 左右,置入1ml 含有1.0ml PBS(或生理鹽水)5ml 離心管中,立即送檢。

(3) 組織臟器:取發(fā)病動(dòng)物腸道組織及腸系膜淋巴結等組織約1g,置一1.5ml的潔凈離心管中,密閉送檢。

3.應避免標本間交叉污染。

4.標本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于28℃冷藏過(guò)夜保存;如需長(cháng)期保存,標本應凍存于-80以下,避免反復凍融。

【檢驗方法】

1. 試劑準備(試劑準備區)

(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實(shí)驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時(shí)離心以去除管壁附著(zhù)液體。

(2)核算當次實(shí)驗所需要的反應數(n),并根據如下表所示反應體系計算當次實(shí)驗所需要的各種試劑量。

n =陰性對照數(1T)+陽(yáng)性對照數(1T)+誤差預留量(1T)+樣本數

單反液配制表(每份)

RT-PCR反應液

15.0 μL

逆轉錄酶

 2.0 μL

Taq

 3.0 μL

 (3)在無(wú)菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時(shí)離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。

2.樣本準備(樣本處理區)

用QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說(shuō)明書(shū)操作。

3.加樣

在上述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉移到PCR儀器上。陰性對照和陽(yáng)性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽(yáng)性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉移到PCR儀器上。

4. PCR(PCR擴增區)

(1)取樣本處理區準備好的PCR反應管,放置在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。

(2)按下表設置儀器核酸擴增相關(guān)參數進(jìn)行PCR擴增。

 

 

反應體積

25 μL

通道選擇

FAM通道采集豬流行性腹瀉病毒熒光信號

PCR

反應

條件

步驟

條件

循環(huán)數

反轉錄

 42℃:10分鐘(min)

1

預變性

95℃:3分鐘(min)

1

預擴增

95℃:5秒(s)

5

55℃:40秒(s)

PCR擴增

95℃:5秒(s)

40

55℃:40秒(s)

(此階段結束時(shí)采集熒光信號)

注:ABI系列熒光PCR儀在設置時(shí)不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None。

【參考值(參考范圍)】

1.試劑盒有效性判定:

(1)陽(yáng)性對照:有典型S型擴增曲線(xiàn)或Ct值≤35。

(2)陰性對照:Ct值>38或無(wú)Ct值,線(xiàn)形為直線(xiàn)或輕微斜線(xiàn),無(wú)指數增長(cháng)期。

2.標本結果判定:

(1)陽(yáng)性:標本檢測結果Ct值≤35或有明顯指數增長(cháng)期。

(2)可疑:標本檢測結果Ct值在35~38范圍內。此時(shí)應對標本進(jìn)行重復檢測,如重復實(shí)驗結果Ct值仍在35~38范圍內,有明顯指數增長(cháng)期,則判定為陽(yáng)性,否則為陰性。

(3)陰性:標本檢測結果Ct值>38或無(wú)Ct值。

【檢驗結果的解釋】

通道及檢測結果

標本檢測結果解釋

FAM

陽(yáng)性(+)

標本中檢出豬流行性腹瀉病毒RNA

陰性(-)

標本中未檢出豬流行性腹瀉病毒RNA

【檢驗方法的局限性】

  • 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的低檢出*可能會(huì )發(fā)生假陰性的結果。
  • 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過(guò)程中操作方式不當容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結果。
  • 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過(guò)程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽(yáng)性結果。

【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的低檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤5%。

【注意事項】

  • 整個(gè)檢測過(guò)程應嚴格按照本說(shuō)明書(shū)要求分別在試劑準備區、樣本處理區和PCR擴增區進(jìn)行操作,各區實(shí)驗服、儀器、耗材應獨立使用,不能混用;實(shí)驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區應配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進(jìn)行操作;三個(gè)區應該配有紫外線(xiàn)殺菌裝置。
  • 為避免RNA降解,樣本處理過(guò)程應在0-4℃條件下操作,且完成實(shí)驗后立即上機檢測;樣本處理過(guò)程中使用的器具耗材應經(jīng)過(guò)無(wú)核酶處理。
  • 每次實(shí)驗應該設置陰、陽(yáng)性對照。
  • 試劑盒所有試劑在使用前應該在常溫下充分融化混勻,并應瞬時(shí)離心。
  • 試劑盒內所配陰性和陽(yáng)性對照在di一次使用前應全部轉移至標本準備區,并單獨存放。
  • 為防止熒光干擾,應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免在PCR反應管上進(jìn)行任何標記。
  • 儀器擴增相關(guān)參數應按照本說(shuō)明書(shū)相關(guān)要求進(jìn)行設置;不同批號試劑不能混用。
  • ABI系列熒光定量PCR儀參數設置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None。
  • 實(shí)驗過(guò)程中產(chǎn)品的廢棄物應該進(jìn)行無(wú)害化處理后方可丟棄。

 

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